التطهير إجراء يراد به تجنب العدوى والقضاء على المكروبات التي تحمل بذور الأمراض المعدية، ولذلك تطهر الأشياء التي لمسها المرضى والأماكن التي أقاموا فيها. ويعد التطهير والتعقيم من الوسائل الضرورية للصحة العامة، ولهما طرائق متعددة، منها المجففات التي تعقم بالحرارة، والأجهزة النشيطة التي تقتل الأحياء المجهرية، والأشعة فوق البنفسجية، والإشعاع الذري، والمطهرات الكيميائية. وتطهير الجروح أمر لا غنى عنه، وقد يكون الكحول مطهرًا نشيطًا لكنه مؤلم، فيستعاض عنه أحيانًا بمركبات فعالة لا تحدث ألمًا يذكر.