تعقيم المأكولات هو القضاء على الجراثيم التي تحتويها الأغذية للمحافظة عليها أطول مدة ممكنة. وتعقم الأدوات الجراحية قبل استعمالها، كما تعقم المستحضرات والأشياء بإزالة كل أثر للحياة الجرثومية فيها، وذلك بمواد مطهرة كالكحول وماء الأكسجين والكلوروفورم، أو بوسائل فعالة كالأشعة فوق البنفسجية ومنتجات الأوزون، إضافة إلى التعقيم بالمرجل المطهر والقدور الضاغطة. وتستعمل القدور الضاغطة في تعقيم المعلبات الغذائية، غير أن بعض الأطعمة المحفوظة يفضل بسترها حتى تحافظ على طعمها الأصلي، ولو لم تبق سليمة مدة طويلة.