الخلاف حول الأئمة عند طوائف الشيعة موضوع يتصل بتباين المذاهب الشيعية في عدد الأئمة وتسلسلهم ومكانتهم الدينية، وما ترتب على ذلك من ظهور فرق مختلفة داخل التشيع. تذكر الروايات الجدلية أمثلة لمطالبات بالإمامة أو الخلافة من شخصيات منسوبة إلى بيوت الأئمة، مثل محمد بن الحنفية وعبد الله بن جعفر الصادق ومحمد بن جعفر الصادق وجعفر بن علي الهادي، وقد أدى اختلاف المواقف من هذه المطالبات إلى نشوء اتجاهات كالكيسانية والفطحية وغيرها. يعكس هذا الموضوع تعقيد التاريخ المذهبي الشيعي وتداخل النصوص والروايات والسلطة والانتساب الأسري في تشكيل الفرق.