تاريخ غينيا بيساو يتشكل من تداخل مجتمعات محلية قديمة وهجرات لاحقة ونفوذ إمبراطوريات غرب أفريقيا ثم الاستعمار البرتغالي. سكنت المنطقة شعوب مثل الجولا والبابل والمانجاك والبالانتا والبيافادا، ثم دخلت إليها جماعات الماندينكا والفولاني، فدفعت بعض السكان الأوائل نحو الساحل والجزر وأعادت تشكيل الخريطة الاجتماعية. ارتبطت أجزاء من البلاد بمملكة كابو ذات الصلة بإمبراطورية مالي، وازدهرت فيها شبكات تجارة داخلية وساحلية شملت الفلفل وجوز الكولا والحديد والملح والأسماك المجففة والمنسوجات والعبيد. أقام البرتغاليون مراكز تجارية على الساحل، لكن سلطتهم ظلت محدودة أمام الممالك والجزر والمحاربين المحليين، ولا سيما في أرخبيل بيجاجوس، إلى أن توسع الاستعمار تدريجياً وفرض سيطرته الكاملة على البلاد بعد مقاومات متكررة.