الأحياء الدقيقة كائنات حية متناهية الصغر لا ترى غالباً بالعين المجردة، وتشمل الجراثيم والفطريات والعتائق والأوليات والطحالب الدقيقة وبعض الكائنات المجهرية الأخرى، ويدرسها علم الأحياء الدقيقة. توجد هذه الكائنات في التربة والماء والهواء وأجسام الكائنات الحية، ولها أدوار بيئية وصناعية وطبية مهمة، فهي تشارك في التحلل وتدوير العناصر وإنتاج الأغذية والإنزيمات والمضادات الحيوية والفيتامينات، وقد تكون نافعة في الهضم والتوازن الحيوي أو ممرضة مسببة لأمراض خطيرة.