الحرب الأهلية الطاجيكستانية نزاع داخلي اندلع بعد تفكك الاتحاد السوفييتي بين الحكومة المركزية وقوى معارضة ذات خلفيات إقليمية وسياسية وإسلامية وديمقراطية. نشأ الصراع من تهميش مناطق وجماعات ومن تنافس على السلطة في دولة حديثة الاستقلال، وتسبب في ضحايا ونزوح واسع وتدخلات إقليمية، وانتهى بتسوية سياسية أدخلت المعارضة في مؤسسات الحكم، وبقي من الأحداث المؤسسة لتاريخ طاجيكستان المعاصر.