جامع مرجان مسجد أثري في بغداد يقع في شارع الرشيد بمنطقة الشورجة، وأصله مدرسة علمية عرفت بالمدرسة المرجانية شيدها أمين الدين مرجان وجعل التدريس فيها على المذاهب الأربعة، ووقف لها عقارات ومرافق لخدمة طلبة العلم. ضمت المدرسة غرفاً للمدرسين ومستشفى يطل على دجلة، ودُفن مؤسسها فيها تحت قبة جميلة، ثم حولت لاحقاً إلى جامع تقام فيه الصلوات والجمعة والعيدان. تعرضت المدرسة في مرحلة لاحقة للهدم واقتطع جزء كبير منها لتوسعة شارع الرشيد، ولم يبق من أصلها إلا بابها الأثري. ارتبط الجامع بأسماء علماء وخطباء من آل الألوسي وغيرهم، كما ضم مكتبة نادرة نُقلت إلى مكتبة الأوقاف العامة قبل أن تتعرض للضياع والحرق في ظروف لاحقة.