٥-ميثيل سايتوسين مركب ناتج عن مثيلة قاعدة الدنا سايتوسين حيث تُضاف مجموعة ميثيل CH3 إلى الذرة رقم ٥ من حلقة البيريميدين، ويؤثر هذا التعديل على ضبط النسخ الجيني وتعبير الجينات دون تغيير تسلسل الدنا نفسه، ويُدرَس ضمن علم التخلق ويظهر أيضاً كنيوكليوسيد ٥‑ميثيل سيتيدين.
