خلل التنسج الشرجي حالة قبل سرطانية تحدث عندما تصاب بطانة القناة الشرجية بتغيرات خلوية شاذة، وتقسم إلى آفات حرشفية داخل الظهارة منخفضة الدرجة (LSIL) وعالية الدرجة (HSIL). يرتبط غالباً بعدوى فيروس الورم الحليمي البشري وقد تكون الحالات عديمة أعراض أو تظهر كتل حول الفتحة الشرجية.