مشكلة المياه في مصر قضية استراتيجية تتصل بمحدودية مورد النيل وتزايد السكان والتوسع الزراعي والعمراني وتغير المناخ ومشروعات السدود في أعالي النهر. تعتمد مصر اعتماداً شديداً على النيل، ولذلك تمثل أي تغيرات في حصتها أو كفاءة استخدامها تحدياً للأمن الغذائي والصحي والاقتصادي. وتكمن خطورة المشكلة في أنها تجمع بين الجغرافيا والاتفاقات الدولية والسياسة الإقليمية وإدارة الاستهلاك المحلي.