الإسلام في بوتسوانا دين أقلية أدخله مهاجرون مسلمون من جنوب آسيا في الحقبة الاستعمارية، ويبلغ عدد المسلمين نحو ٥٠٠٠ وفق تعداد ٢٠٠١ (<١% من السكان). نشأت جاليات ومساجد في المدن، ويقدَّر التواجد الشيعي بين ١% و٣% من المسلمين، والعلاقات بين الأديان سلمية عادةً.