قد يؤدي الاستعمال الطويل لمثبطات مضخة البروتون إلى فرط نمو البكتيريا في الأمعاء لأنها تخفّض حموضة المعدة، فتضعف الحاجز الطبيعي الذي يقتل كثيرًا من الجراثيم الداخلة مع الطعام. وعندما تقلّ الحموضة أكثر من اللازم، تستطيع بعض البكتيريا أن تبقى حيّة وتتجاوز المعدة إلى الأمعاء الدقيقة، ثم تتكاثر هناك على نحو غير طبيعي، ما يرفع احتمال ظهور أعراض الانتفاخ والغازات واضطراب الهضم.
سبحان الله