نظام تشغيل ديبيان يعتمد على نظام إدارة حزم يتكوّن من طبقات؛ الأداتان الرئيسيتان هما دي-بي-كي-جي كأداة منخفضة المستوى لمعالجة حزم ديب، وإيه-بي-تي كأداة عالية المستوى لتسهيل البحث عن الحزم وتنزيلها وترقيتها وإدارة تبعياتها. توجد واجهات ومجلدات برمجية مختلفة تستند إلى إيه-بي-تي مثل إيه-بي-تي-جيت وأبتيتيود وبرامج واجهة رسومية مثل سينابتك التي توفر واجهات مستخدم لإدارة الحزم وتثبيتها وحذفها وتحديثها، ويستخدم هذا النظام صيغ حزم معيارية تتيح التحكم الكامل بعمليات التثبيت والتهيئة والتحديث داخل بيئة ديبيان.