علم المسطحات المائية فرع علمي يدرس الأنظمة المائية الداخلية مثل البحيرات ويعتمد على السجل الجيولوجي وعلوم البيئة القديمة لإعادة بناء بيئات المياه الماضية وتقييم تأثيرات التغير المناخي وفرط التغذية والحموضة وعمليات تطور مجتمعاتها الداخلية وديناميكا استعمارها وتأخرها الحيوي.
