ينتج عن تشغيل المفاعلات النووية نفايات مشعة قد تبقى خطرة لفترات طويلة جدًا، ولذلك تتطلب عمليات تخزين وعزل دقيقة. كما أن الحوادث النووية، رغم ندرتها، قد تؤدي إلى آثار صحية وبيئية واسعة، وهو ما يدفع بعض الدول إلى تقليل اعتمادها على هذا المصدر أو التخلي عنه تدريجيًا.
