القطب المغناطيسي الجنوبي نقطة في نصف الكرة الجنوبي يكون عندها المجال المغناطيسي للأرض متجهاً رأسياً إلى أعلى، وهو يختلف عن القطب الجنوبي الجغرافي وعن القطب الجيومغناطيسي الجنوبي. تتحرك هذه النقطة باستمرار نتيجة تغيرات المجال المغناطيسي للأرض، وتقع قرب سواحل أنتارتيكا في منطقة تتبدل إحداثياتها مع الزمن بفعل الانجراف القطبي. ورغم تسميته بالقطب المغناطيسي الجنوبي، فإن طبيعته الفيزيائية تقابل قطباً مغناطيسياً شمالياً بسبب تجاذب الأقطاب المتعاكسة، ويستخدم فهم موقعه وحركته في دراسة المجال المغناطيسي الأرضي والملاحة والعلوم الجيوفيزيائية.