في موسمه الأخير بصفته مدربًا لفريق كرة السلة للرجال في "برنستون تايغرز"، قاد جون تومبسون الثالث فريق ٢٠٠٣-٠٤ إلى المشاركة في بطولة الرابطة الوطنية لرياضة الجامعات لكرة السلة للدرجة الأولى للرجال لعام ٢٠٠٤، وهو إنجاز شكّل خاتمة فترة تدريبه مع الفريق في ذلك الموسم.
