قد يختلط التعرّف على مرجان الكأس ومرجان الخس المسامي تحت الماء، إذ تتشابه بنيتهما العامة إلى حدّ يجعل التمييز بينهما صعباً على غير المختصين. ويحدث هذا الالتباس بسبب التقارب في الشكل والملمس والهيئة المتفرعة أو المتموجة التي تبدو متماثلة من مسافة قريبة، ما يجعل الحكم عليهما في البيئة البحرية بحاجة إلى ملاحظة أدق للتفاصيل البنيوية التي تفرّق بين نوع وآخر.
