كروموسوم إكس أحد الكروموسومين الجنسيين في الثدييات، ويشارك مع كروموسوم واي في تحديد الجنس الوراثي. تحمل الأنثى عادة زوجاً من كروموسومات إكس، بينما يحمل الذكر كروموسوم إكس وآخر واي، ويضم كروموسوم إكس عدداً كبيراً من الجينات المرتبطة بوظائف حيوية. يرتبط هذا الكروموسوم بصفات وأمراض وراثية متعددة، كما أثارت آليات تعطيل أحد كروموسومي إكس في الإناث اهتماماً واسعاً في علم الوراثة.