كان يوهان لودفيغ هولشتاين أحد المؤسسين المشاركين للأكاديمية الملكية الدنماركية للعلوم والآداب، وهي مؤسسة علمية مرموقة أُنشئت لتعزيز البحث والمعرفة في الدنمارك. وقد ارتبط اسمه بهذه الخطوة التأسيسية بوصفه من الشخصيات التي أسهمت في وضع الأساس المؤسسي لعمل الأكاديمية، بما منحها حضوراً مبكراً في الحياة العلمية والفكرية الدنماركية.