تولى الخليفة الفاطمي الأخير، العاضد، الحكم وهو طفل، فكان نفوذ وزرائه هو الغالب على شؤون الدولة في عهده، ولم يمارس سلطة فعلية مستقلة على نحو واضح. وقد انتهى حكمه بعد أن ألغى صلاح الدين الأيوبي النظام الفاطمي، ثم توفي العاضد بعد ذلك بأيام قليلة، في مرحلة مثّلت انتقالاً حاسماً من الحكم الفاطمي إلى الحكم الأيوبي في مصر.

أبو تميم معد المعزّ لدين الله (٩٣٢–٩٧٥): الخليفة الفاطمي الرابع والإمام الإسماعيلي الرابع عشر، نقل مركز الدولة الفاطمية من إفريقيّة إلى مصر وأنشأ القاهرة عاصمةً فاطمية عام ٩٦٩، وعُرف بتسامحه الديني ورعايته للثقافة والإدارة.

جوهَر القائد الفاطمي قاد صلاة الجمعة في مدينة الفسطاط باسم الخليفة المعز لدين الله في ٩ يوليو ٩٦٩، مما مثل إكمال الغزو الفاطمي لمصر بشكل رمزي. مراسم قيادة جوهَر للصلاة باسم المعز لدين الله في الفسطاط اعتُبرت إعلانًا رسميًا لسلطة الدولة الفاطمية على القاهرة ومصر بعد الانتصار العسكري، إذ إن إقامة صلاة الجمعة باسم الخليفة علامة تقليدية على انتقال السيادة الدينية والسياسية، وتجسد حدث قيادة جوهَر للمصلين لحظة تأسيس النفوذ الفاطمي في المنطقة ودمجه ضمن إطار الخلافة الجديدة تحت اسم المعز لدين الله.

العزيز بالله هو الخليفة الفاطمي الذي استلم الخلافة بعد وفاة الخليفة المعز لدين الله، وقد تولى العزيز بالله الحكم في ١٢ ديسمبر من سنة ٩٧٥. استلام العزيز بالله للخلافة يعني انتقال السلطة الدينية والسياسية في الدولة الفاطمية إليه كخليفة بعد رحيل المعز لدين الله، ويشير التاريخ المذكور إلى يوم تحديد بدء حكمه الذي مثل استمراراً للسلالة الفاطمية في قيادة الأقاليم التي كانت تحت سيطرة الدولة الفاطمية آنذاك.

القائم بأمر الله الفاطمي هو محمد بن عبيد الله بن الحسين الخليفة الفاطمي الثاني والإمام الثاني عشر في سلسلة أئمة الشيعة الإسماعيلية، تولى الخلافة عام ٣٢٢هـ، شهد خلال عهده حملات فاطمية على الإسكندرية ومن ثم هزيمة هناك وغزوات بحرية على جنوة وسردينيا، ومواجهة ثورة الخوارج بقيادة ابن كيداد، وتوفي عام ٣٣٤هـ وخلفه ابنه المنصور إسماعيل.