كانت مدينة سان فرانسيسكو تُعرف في الأصل باسم «يربا بوينا» قبل أن يُغيَّر اسمها في ١٨٤٨. وقد ارتبط هذا الاسم القديم بالفترة التي سبقت التحول العمراني والسياسي للمدينة، ثم استقر الاسم الحالي مع ازدياد أهميتها بعد ذلك التاريخ.