قد تتكوّن بعض الجزيئات من عدد قليل من الذرات، في حين تحتوي جزيئات أخرى على عشرات أو مئات أو آلاف الذرات المرتبة في سلاسل أو حلقات طويلة. ويُعد جزيء فيتامين أ مثالًا على الجزيئات العضوية التي تتكوّن أساسًا من ذرات الكربون والهيدروجين والأكسجين، ويؤثر ترتيب هذه الذرات الدقيق في وظيفة الجزيء داخل الجسم وخصائصه الكيميائية.