إينوسنت الرابع (نحو ١٢٠٠ - ١٢٥٤): بابا روما بين عامي ١٢٤٣ و١٢٥٤، ويُعد من أعظم بابوات العصر الوسيط. تبنى سياسة إينوسنت الثالث، فنشب صراع عنيف بينه وبين الإمبراطور فريدريك الثاني، واضطر إلى مغادرة روما والإقامة في مدينة ليون الفرنسية حتى وفاة فريدريك سنة ١٢٥٠، كما عقد مجمع ليون الأول.

إينوسنت الثالث (نحو ١١٦١ - ١٢١٦): بابا روما بين عامي ١١٩٨ و١٢١٦، وبلغت البابوية في عهده أوج قوتها ومكانتها. عد نفسه مسؤولًا عن إصلاح المجتمع المسيحي وهداية النصارى، وآمن بتفوق السلطة الروحية على السلطة الزمنية، فنشبت خلافات بينه وبين عدد من ملوك أوروبا وأباطرتها، كما شن الحملة الصليبية الرابعة سنة ١٢٠٢.

إينوسنت السادس ( - ١٣٦٢): بابا روما بين عامي ١٣٥٢ و١٣٦٢، وأقام في أفينيون خلال الفترة التي ابتعد فيها البابوات عن روما. حاول إعداد حملة صليبية ضد الأتراك العثمانيين، وسعى إلى توحيد الكنيستين الشرقية والغربية، لكنه لم ينجح في تحقيق أي من هذين الهدفين.

غريغوريوس السابع (نحو ١٠٢٠ - ١٠٨٥): بابا روما بين عامي ١٠٧٣ و١٠٨٥، ويُعد من أبرز البابوات المصلحين في القرون الوسطى. عزز سلطة الكرسي الرسولي الزمنية، وأدخل إصلاحات واسعة في إدارة الكنيسة، وخاض نزاعًا مع الإمبراطور هنري الرابع بشأن حق تعيين كبار الأساقفة، وانتهى النزاع بخضوع هنري له في كانوسا عام ١٠٧٧.

إينوسنت الثالث عشر (١٦٥٥ - ١٧٢٤): بابا روما بين عامي ١٧٢١ و١٧٢٤، واعترف بجيمس الثالث، ابن جيمس الثاني والمطالب بالعرش الإنجليزي، ملكًا على إنجلترا. وعده بمزيد من التأييد إذا جهز حملة لاستعادة عرش أبيه، وجعل المذهب الكاثوليكي الدين الرسمي للبلاد.