الانقلاب العسكري في هندوراس في ٣ أكتوبر ١٩٦٣ يمثل بداية مرحلة من الحكم العسكري امتدت نحو عقدين في تاريخ البلاد. شهدت هندوراس في ذلك اليوم اندلاع انقلاب عنيف أطاح بالحكومة المدنية وأدى إلى استلام القيادات العسكرية مقاليد السلطة، ومن ثم فرض إدارة عسكرية تسيطر على مؤسسات الدولة وتقيّد العمل الحزبي والحريات السياسية. يُنظر إلى انقلاب ٣ أكتوبر ١٩٦٣ كنقطة فاصلة في مسار النظام السياسي في هندوراس، حيث أدت السيطرة العسكرية المتواصلة إلى تغيّرات في السياسات الداخلية والخارجية وتأثيرات طويلة الأمد على الحياة المدنية والتنمية الوطنية.