فيروس الخفافاش كورونا ويف١ الشبيه بفيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة سلالة من فيروسات كورونا قريبة من فيروس SARS‑CoV، عُزلت من خفاش حدوة الحصان الصيني (Rhinolophus sinicus)، وتحمل جينوم رنا إيجابي أحادي السلسلة مغلف؛ وتدعم تحليلاتها أن الخفافيش خزان طبيعي وإمكانية انتقال مباشر إلى البشر.

الفيروس التاجي المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة نوع من فيروسات كورونا بيتا، يصيب البشر والخفافيش وبعض الثدييات الأخرى، ويتميز بأنه فيروس رنا مغلف مفرد السلسلة موجب الاتجاه. تضم هذه المجموعة سلالات تسببت في تفشيات تنفسية خطرة لدى البشر، منها الفيروس المسبب للسارس وفيروس كورونا المرتبط بمرض كوفيد، مع وجود سلالات أخرى معروفة أساساً في الحيوانات. تعد الخفافيش مستودعاً رئيسياً لهذه الفيروسات، وقد يحدث انتقال بين الأنواع عبر حيوانات وسيطة أو بصورة مستقلة إلى الإنسان. يتميز الفيروس بقدرته على دخول الخلايا عبر مستقبلات محددة، وبجينوم كبير نسبياً يرمز لبروتينات بنيوية وغير بنيوية تساعده على التكاثر، مما جعله محوراً مهماً في دراسات الأوبئة والوقاية واللقاحات.

فيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية هو فيروس ريبوزي مفرد الخيط موجَب ينتمي إلى جنس فيروسات كورونا بيتا ويسبب التهاباً تنفسياً قد يتطور إلى التهاب رئوي وفشل كلوي. ظهر أولاً في ٢٠١٢ وأُبلغت حالات في أكثر من ٢١ دولة؛ ينتقل عبر الرذاذ والسطوح ويُشخّص بتقنية تفاعل البوليميراز والعزل، ولا يوجد علاج نوعي حتى الآن، والعلاج داعم.

تفشي فيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية (ميرس-كوفي) بدأ في ٢٠١٢ مع أول حالة مُبلّغ عنها في السعودية، وانتشر لاحقًا إلى ٢٤ دولة مسببًا أكثر من ١٠٠٠ إصابة و٤٠٠ وفاة حتى منتصف ٢٠١٥. الفيروس ينتمي إلى فيروسات كورونا بيتا، وسُجلت انتقالات محددة من الإبل إلى الإنسان وأُتخذت تدابير مراقبة ورصد عالمية للحد من انتشاره.

تفشي فيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية في ٢٠١٨ كان موجة إصابات سجلت أساسًا في المملكة العربية السعودية مع ١٤٧ حالة خلال العام وارتفاع مبكر في فبراير. المتلازمة تنشأ في شبه الجزيرة العربية وتظهر أعراضها خلال ٢ إلى ١٤ يومًا وتشمل الحمى والسعال وضيق التنفس، مع مراقبة دولية وحجر صحي للمخالطين.