نظام الكبد يشمل القنوات الصفراوية داخل الكبد والمرارة والقناة الصفراوية المشتركة؛ تفرز خلايا الكبد صفراً يحتوي ماءً وشواردًا وأحماضًا صفراوية وكوليسترول وبيليروبين، تُجمع إلى القناة الكبدية ثم تُخزن في المرارة وتُفرز إلى الإثني عشر؛ انسداد القنوات يسبب ألمًا صفراويًا وركودًا صفراويًا واصفرار الجلد وبياض العينين.

الحصاة الصفراوية جسم بلوري يتكون في المرارة أو القنوات الصفراوية نتيجة تغيرات في تركيز مكونات العصارة الصفراوية، مثل الكوليسترول والأملاح الصفراوية والبيليروبين. قد تبقى الحصوات صامتة بلا أعراض، لكنها قد تسبب ألما شديدا في أعلى البطن عند انسداد القنوات، وقد تترافق مع غثيان وقيء أو تؤدي إلى مضاعفات مثل التهاب المرارة أو اليرقان الانسدادي أو التهاب البنكرياس. ترتبط عوامل الخطر بالسمنة والحمل والتاريخ العائلي والسكري وأمراض الكبد وفقدان الوزن السريع وبعض العوامل الغذائية. يعتمد التشخيص غالبا على الأعراض والتصوير بالموجات فوق الصوتية، وقد يلزم العلاج الجراحي عند تكرر النوبات أو ظهور المضاعفات.

سرطان الأوعية الصفراوية ورم خبيث ينشأ من بطانة القنوات الصفراوية، وقد يسبب انسداداً في جريان الصفراء واضطراباً في وظائف الكبد. يعد من السرطانات صعبة التشخيص وغالباً يتطور بصمت حتى مراحل متقدمة. ترتبط بعض حالاته بأمراض القنوات الصفراوية المزمنة أو عدوى طفيلية في مناطق معينة أو عوامل التهابية أخرى. يعتمد العلاج على الجراحة إذا كان الورم قابلاً للاستئصال، وقد يستعمل العلاج الكيميائي أو التلطيف لتخفيف الانسداد والأعراض.

تصوير الأقنية الصفراوية تقنية تصوير طبي بالأشعة تُظهر القنوات الصفراوية بعد حقن مادة تباين، وتشمل طرقًا مثل التصوير عبر الكبد عن طريق الجلد (PTC) والتصوير بالتنظير الباطني بالطريق الراجع (ERCP) المستخدم للتشخيص والعلاج، كما يُستخدم التصوير بالرنين المغناطيسي (MRCP) كبديل غير غازي.

متلازمة ميريزي هي حالة نادرة تؤدي إلى انسداد القنوات الصفراوية بسبب انغراس حصوة في القناة أو عنق المرارة مع تليف أو ضغط خارجي أوجروح ناسور. تسبب يرقانًا انسداديًا وأعراض التهاب المرارة أو الأقنية الصفراوية، وتصنّف إلى أربعة أنواع حسب حجم العيب، ويُشخَّص بالتصوير ويعالج جراحيًا بما في ذلك استئصال المرارة أو مفاغرة القناة الصفراوية.