علم المناعة الحاسوبي مجال يجمع علم المناعة بالمعلوماتية الحيوية والحوسبة والرياضيات لتحويل البيانات المناعية الكبيرة إلى مسائل حاسوبية وحلها ثم تفسير النتائج مناعيًا؛ يشمل رصف التسلسلات، تنبؤات بنية البروتين، تحليل شبكات الإشارة وتآثرات البروتينات لفهم الاستجابات المناعية وتطبيقات في تشخيص وعلاج الأمراض والبحث الواسع النطاق لآليات الجهاز المناعي.