مسجد يونس باي كان مسجداً عثمانياً في مدينة كوموتيني بتراقيا الغربية في اليونان، بُني بعد الفتح العثماني وتاريخ بنائه غير معروف، ولم يبق منه اليوم سوى أربعة جدران خارجية وباب بعد انهيار السقف والجدران الداخلية ويُستخدم باطنه كساحة لعب محلية، وترد مخططات تخطيط المدينة ١٩٩٣ بخطة لمصادرة نحو ٤١.٢٥ مترًا مربعًا من أرضه.
