مضخة البروتون بروتين غشائي مدمج ينقل بروتونات عبر أغشية الخلايا أو العضيات مكوّناً تدرجًا كهروكيميائيًا يخزن طاقة كامنة تُستخدم لاحقًا في عمليات خلوية مثل التنفس وامتصاص المغذيات وتوليد الإمكانات؛ لا تنتج الطاقة بنفسها بل تُبني التدرج الذي تغذيه نقل إلكترونات أو الضوء أحيانًا.
