٣-ميثيل سيتيدين مركب نوكليوسيدي قاعدته ٣-ميثيل سايتوسين، وهو سايتوسين ميثيلي مرتبط بسكر الريبوز؛ يتواجد طبيعياً في بعض جزيئات الرنا الناقل والرنا الريبوسومي، وحضور مجموعة الميثيل على النيتروجين في الموضع ٣ يمنع تكوين زوج قاعدي له ويؤثر على ثبات وبنية الحمض النووي الريبي الوظيفية.