استقلال جنوب السودان جاء بعد نزاع طويل تعود جذوره إلى مرحلة ما قبل استقلال السودان عام ١٩٥٦، في ظل التفاوتات السياسية والاقتصادية والثقافية بين الشمال والجنوب وشعور قطاعات واسعة من الجنوبيين بالتهميش. بدأت الحرب الأهلية الأولى عام ١٩٥٥ وانتهت باتفاق أديس أبابا عام ١٩٧٢، ثم اندلعت الحرب الثانية عام ١٩٨٣ بين الحكومة السودانية والحركة الشعبية لتحرير السودان بقيادة جون قرنق، واستمرت حتى ٢٠٠٥.

استقلال جنوب السودان أصبح ممكناً بعد توقيع اتفاقية السلام الشامل في نيفاشا بكينيا خلال يناير ٢٠٠٥. منحت الاتفاقية الجنوب حكماً ذاتياً لمدة ٦ سنوات، ونظمت تقاسم السلطة وعائدات النفط، ونصت على إجراء استفتاء يختار فيه السكان بين الوحدة والاستقلال. أنهت الاتفاقية أطول مراحل الحرب، لكنها لم تحسم جميع الخلافات المتعلقة بالحدود والنفط ومنطقة أبيي.

استقلال جنوب السودان أُقر في استفتاء يناير ٢٠١١، عندما أيد ٩٨.٨٣% من المشاركين الانفصال. أُعلنت جمهورية جنوب السودان رسمياً في ٩ يوليو ٢٠١١، واتخذت جوبا عاصمةً لها وتولى سلفا كير ميارديت رئاستها، ثم أصبحت الدولة العضو ١٩٣ في الأمم المتحدة.