عين الخندق ينبوع في بلدة عين كارم ضمن جبال القدس يتأصل من مجموعة عيون ماء تمتد على خط طول يصل إلى ٢ كيلو متر، وتتدفق مياهها بين الصخور في نظام عيون متصلة تروي شبكة سقي واسعة في وادي يوسف شرق حجر اليَاقوت؛ يعد منبعاً لطريق القدس بطول نحو ٥٠ مترًا وعمق مياه جارية يقارب المتر، ويقع على ارتفاع ٥٨٠ مترًا فوق سطح البحر.