محمد الخليلي (توفي ١٧٣٤) عالم إسلامي شغل منصب مفتي المذهب الشافعي في القدس أواخر القرن السابع عشر وبدايات القرن الثامن عشر، ووصفه رشيد خالدي بأنه من أبرز الشخصيات الدينية في تلك الحقبة، وكان مرجعًا في الفقه الشافعي والتعليم الشرعي وإدارة الوقفيات وتقديم الاستشارات الدينية لأهل المدينة.
مسجد الشيخ الخليلي مسجد أثري فلسطيني يعود إلى الحقبة العثمانية ويقع داخل أسوار البلدة القديمة في القدس غرب المسجد الأقصى قرب باب السلسلة، بُني على الطراز المملوكي بطول نحو ١٢ مترًا وعرض ٥ أمتار، احتوى على محراب وسبُل للصلاة وكان يُصلى فيه سابقًا قبل أن يتعرض للاعتداء ويُسكن، وسُمي باسم الشيخ محمد الخليلي عالم الحديث والتفسير المتوفى عام ١٧٣٤.
