وُجِّهت إلى الدكتور نسيم أشرف اتهامات في صحيفة «داون» بأنه كان يملك أجندة خفية تهدف إلى نزع الطابع الإسلامي عن منتخب باكستان للكريكيت، وهو ما أضفى على دوره جدلاً واسعاً في الأوساط الرياضية والإعلامية. وقد ارتبطت هذه المزاعم بتأويلات حول توجهاته وإدارته لشؤون المنتخب، من دون أن يعني ذلك بالضرورة ثبوت تلك النوايا على نحو قاطع.