البحرية الإستونية (بالإستونية: Merevägi) قوات بحرية تابعة لقوات الدفاع الإستونية تشكل واحدة من أصغر البحرية في العالم، تتكوّن من ست سفن رئيسية ذات إزاحة مجتمعة أقل بكثير من ١٠,٠٠٠ طن، وتستخدم بادئة السفن Eesti Mereväe Laev (اختصارًا EML) وشاركت في تدريبات بحرية مشتركة لحلف الناتو.
