مثيلة الهستونات تعديل كيميائي في بقايا الأحماض الأمينية للهستون بإضافة مجموعة أو اثنتين أو ثلاث مجموعات ميثيل، تغير بنية النيوكليوسومات وتعدل تفاعلها مع بروتينات النسخ؛ قد تسهم مثيلة محددة مثل ميثيل H3K4 في تنشيط الجينات بينما تسهم مثيلات على ليسين أو أرجنين في كبت التعبير.
