علم الأحياء الدقيقة علم يدرس الكائنات الحية الدقيقة التي لا ترى غالباً بالعين المجردة، مثل البكتيريا والفطريات والأوليات وبعض الطحالب، مع ارتباطه بدراسة الفيروسات في مجال مستقل قريب. يهتم هذا العلم ببنية هذه الكائنات ونموها وتكاثرها ووراثتها وعلاقاتها بالبيئة والإنسان والحيوان والنبات، ويكشف جوانبها النافعة والضارة معاً. وتظهر أهميته في الطب والمناعة وصناعة المضادات الحيوية والأغذية والتخمير والزراعة والتربة والبيئة، كما يسهم في فهم الأمراض وحماية الإنسان والكائنات الحية من أخطار الميكروبات الممرضة.