مذبحة مكتب التحقيقات الفيدرالي في ميامي حدثت في ١١ أبريل ١٩٨٦ في مقاطعة دايد بفلوريدا وتضمن اشتباكًا مسلّحًا نهاريًا بين لصيْن مسلحين استهدفا بنوكًا أو عربات مصفحة وعملاء تابعين لمكتب التحقيقات الفيدرالي أثناء مطاردتهما. أسفرت المواجهة عن مقتل العميلين جيري إل. دوف وبنجامين ب. بروجان وإصابة خمسة عملاء آخرين بجروح، وقد أدت نتائج التحريات والتحليل بعد الاشتباك إلى تطوير ذخيرة شعبية ذات عيار جديد عُرفت باسم أربعون إس آند دبليو بهدف تحسين قدرة ذوي الإنجازات الميدانية على التوقف وإيقاف المهاجمين في مثل هذه الحالات.

روبرت هانسن عميل في مكتب التحقيقات الفيدرالي الأمريكي اعتُقل في ١٨ فبراير ٢٠٠١ بتهمة التجسس لصالح الاتحاد السوفيتي. يُعرف روبرت هانسن بنشاطه الاستخباراتي المزدوج الذي تضمن تسليم معلومات حساسة ووثائق سرية إلى الاستخبارات السوفيتية ثم الروسية، وقد كشفت التحقيقات عن خيانته الطويلة للمصالح الأمريكية. أدّت الأدلة والاعترافات إلى إدانة روبرت هانسن وحكمت عليه المحكمة بالسجن مدى الحياة، وهو حكم يعكس خطورة الجرائم الموجهة ضد أمن الدولة والثقة المهنية الممنوحة لعميات الأمن والاستخبارات.

أُلقي القبض على أوليغ نيكولاينكو من قِبل مكتب التحقيقات الفيدرالي، الذي يعتقد أنه كان مسؤولاً عن نحو ثلث الرسائل المزعجة الإلكترونية في العالم. ويعكس هذا الاتهام حجم النشاط غير المشروع المنسوب إليه، إذ ارتبط اسمه بعمليات إرسال واسعة النطاق استهدفت مستخدمين في دول متعددة، ما جعله من أبرز الأسماء المرتبطة بهذه الظاهرة الرقمية التي تسببت في إرباك واسع للبريد الإلكتروني وخدمات الاتصال عبر الشبكة.

في نزاع التشفير بين مكتب التحقيقات الفيدرالي وشركة "آبل"، قضت قاضية فدرالية في بروكلين بأن قانون الأوامر القضائية الشامل لعام ١٧٨٩ لا يمكن استخدامه لإلزام الشركة بفتح قفل هاتف "آيفون" يعود إلى تاجر مخدرات. ويعني هذا الحكم أن السلطات لا تستطيع الاعتماد على ذلك القانون القديم لفرض تعاون تقني من هذا النوع على الشركة، ما يحدّ من توسيع تفسيره ليشمل اختراق حماية الأجهزة المشفّرة.

كان العميل الخاص في مكتب التحقيقات الفيدرالي «هيرمان هوليس» من المشاركين في الاشتباكات المسلحة التي خاضها المكتب مع «جون ديلينجر» و«بيبي فيس نيلسون»، كما يُحتمل أنه كان ضالعاً أيضاً في المواجهة مع «بريتي بوي فلويد». وقد ارتبط اسمه بهذه الحوادث ضمن مرحلة مطاردة أبرز المجرمين المطلوبين في ذلك الوقت، حين كان المكتب يواجه عصابات مسلحة في عمليات أمنية شديدة الخطورة.