توجد الخفافيش طبيعياً في جميع قارات العالم المأهولة تقريباً باستثناء القارة القطبية الجنوبية، وتمتد شمالاً إلى مناطق قريبة من الدائرة القطبية وجنوباً إلى أطراف القارات الباردة. ويعكس انتشارها الواسع قدرتها على التكيف مع الصحارى والغابات والمدن والكهوف والجزر والمرتفعات.