توفر بيوت الخفافيش المصممة جيداً ملاجئ بديلة في المناطق التي تقل فيها تجاويف الأشجار أو تُغلق فيها المباني القديمة. وقد تستضيف البيوت الكبيرة في المناخات الدافئة آلافاً أو عشرات الآلاف من الخفافيش، لكن نجاحها يتوقف على التصميم والارتفاع والتعرض للشمس والقرب من الماء والغذاء، ولا يكفي تعليق صندوق عشوائي.