يُعرف روث الخفافيش باسم الغوانو، وهو غني غالباً بالنيتروجين والفوسفور وعناصر أخرى تفيد التربة إذا استُخدم بجرعات مناسبة. كما يمثل مصدراً أساسياً للغذاء في بعض نظم الكهوف، إذ تعتمد عليه فطريات وحشرات وكائنات أخرى، لكن تراكمه قد يحمل فطريات ضارة إذا جرى التعامل معه من دون وقاية.