تولّى الجنرال أمبروز بيرنسايد قيادة جيش بوتوماك في سياق الحرب الأهلية الأمريكية عام ١٨٦٢، بعد إزاحة الجنرال جورج بي. ماكللان من قيادة الجيش. يعتبر انتقال القيادة هذا حدثًا عسكريًا إداريًا في مسيرة الحرب الأهلية الأمريكية، إذ تعاقبت قيادات عدة على قيادة جيش بوتوماك خلال النزاع، وكان لتبديل القادة تأثيرات على الخطط والروح المعنوية والاستراتيجية المتبعة ضد القوات الكونفدرالية، ويذكر أن مثل هذه التغييرات كانت جزءًا من محاولات الحكومة والقيادة العليا لتحسين أداء الجيش وتحقيق أهداف العمليات الحربية في ذلك العام.

إعفاء الجنرال أمبروز بيرنسايد من قيادة جيش بوتوماك في ٢٦ يناير ١٨٦٣ جاء نتيجة الحملة الكارثية على فريدريكسبرغ خلال الحرب الأهلية الأمريكية؛ أدى أداء القوات تحت قيادة بيرنسايد إلى فقدان الثقة العليا بقيادته، فحُل محله الجنرال جوزيف هوكر الذي تولى مسؤولية تنظيم وإعادة هيكلة قوات جيش بوتوماك بعد الهزيمة بهدف استعادة الفاعلية القتالية والاستعداد للعمليات التالية في مسرح الحرب الأهلية الأمريكية.

مرسوم الجنرال يوليسيس س. غرانت رقم ١١ يتعلق بطرد اليهود من أجزاء من تينيسي وميزيسيبي وكنتاكي خلال الحرب الأهلية الأمريكية. المرسوم رقم ١١ أصدره الجنرال يوليسيس س. غرانت في سياق العمليات العسكرية في جنوب الولايات المتحدة، ونص على إبعاد مجموعات من اليهود من مناطق محددة في ولايات تينيسي وميزيسيبي وكنتاكي، وهو إجراء تمييزي أثار انتقادات واحتجاجات لاحقة من السياسيين والمجتمعات المدنية. يعكس هذا المرسوم موقفاً إدارياً وقانونياً آنذاك تجاه الأقليات الدينية في مناطق الحرب ويُذكر ضمن سياسات الطوارئ العسكرية في فترة الحرب الأهلية الأمريكية.

جيش بوتوماك هو التشكيل العسكري الرئيسي للاتحاد خلال الحرب الأهلية الأميركية، وحُلّ الجيش في تاريخ ٢٨ يونيو ١٨٦٥. حل جيش بوتوماك أنهى وجود هذه القوة المنظمة التي شاركت في معارك كبرى خلال الحرب، وكان حله نتيجة لانتهاء العمليات القتالية باندحار القوات الكونفدرالية واستسلام معظم جيوشها، ما جعل استمرار وجود جيش بوتوماك غير ضروري من الناحية العسكرية والإدارية في سياق إعادة ترتيب القوات الاتحادية بعد الحرب.

في ٦ سبتمبر ١٨٦١ استولى الجنرال الاتحادي يوليسيس إس. غرانت على مدينة باديوكاه في ولاية كنتاكي دون إراقة دماء، وقد منح هذا الاستيلاء قوات الاتحاد السيطرة على مصب نهر تينيسي، ما أتاح للاتحاد نفوذاً استراتيجياً على المجرى المائي المهم وتحرير خطوط إمداد وتحركات بحرية في المنطقة.