تُعد الطماطم من أوائل الأغذية المعدلة وراثياً التي طُرحت تجارياً في الأسواق، إذ جرى تطويرها لتتحمل التخزين والنقل بصورة أفضل مع الحفاظ على جودتها فترة أطول. وقد مثّل ظهورها خطوة مبكرة في تاريخ الأغذية المعدلة وراثياً، لأنه أظهر إمكان توظيف الهندسة الوراثية في تحسين خصائص المحاصيل الزراعية وجعلها أكثر ملاءمة للاستهلاك والتسويق.

تعتمد الكائنات المعدلة وراثيًا على إدخال جينات تمنحها صفات جديدة، مثل مقاومة بعض الحشرات أو الأمراض أو ظروف الجفاف، أو تحسين القيمة الغذائية والإنتاج الزراعي. وقد ساعدت هذه التقنيات في تطوير أصناف زراعية أكثر قدرة على تحمل الظروف البيئية الصعبة، مع استمرار تقييمها علميًا من حيث السلامة والكفاءة.

تعتمد إحدى طرق إنتاج الكائنات المعدلة وراثيًا على استخدام البلازميدات، وهي حلقات صغيرة من الحمض النووي توجد في البكتيريا. ويُدرج الجين المطلوب داخل البلازميد ثم يُنقل إلى البكتيريا، التي تتكاثر لاحقًا حاملةً المادة الوراثية الجديدة، مما يسمح بإنتاج كميات كبيرة من البروتين أو المادة المطلوبة.

تُستخدم بعض الفيروسات المعدلة وراثيًا في التطبيقات الطبية والبحثية بعد إزالة قدرتها على إحداث المرض، حيث تعمل ناقلاتٍ لإيصال جينات علاجية إلى الخلايا المستهدفة. وقد أسهم هذا المجال في تطوير تقنيات العلاج الجيني، التي تهدف إلى تصحيح بعض الاضطرابات الوراثية أو تحسين الاستجابة لبعض الأمراض.

البطاطا المعدلة وراثيا نبات بطاطس خضعت جيناته لتعديل وراثي بغرض إدخال مقاومة للآفات، أو تغيير مستويات مركبات كيميائية تنتجها النبتة، أو منع إسوداد أو كدمات الدرنات؛ وقد رُخّصت في الولايات المتحدة أصناف معدلة لزراعة تجارية مخصصة لإنتاج النشا الصناعي وليس للاستهلاك الغذائي العادي.